Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRIM23P36406 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms