Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms