Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMNAP02545 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMNAP02545 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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