Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM5B3KS81 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM5B3KS81 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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