Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms