Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC96Q2M329 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms