Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms