Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms