Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMPD4Q14CM0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms