Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms