Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms