Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms