Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms