Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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