Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LCP1P13796 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LCP1P13796 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms