Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD8P13378 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD8P13378 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD8P13378 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms