Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms