Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms