Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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IFT52Q9Y366 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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IFT52Q9Y366 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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IFT52Q9Y366 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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IFT52Q9Y366 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFT52Q9Y366 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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