Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1BQ9UD71 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms