Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF7Q9UBF6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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