Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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