Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms