Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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