Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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