Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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