Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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