Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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AP3M2P53677 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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AP3M2P53677 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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