Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRE11P49959 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms