Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms