Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms