Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YY1P25490 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 OR9G1-201ENST00000312153 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 PHBP8-201ENST00000493810 725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC010524.1-201ENST00000596488 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YY1P25490 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 AP001476.2-201ENST00000435738 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 RN7SL405P-201ENST00000582502 289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 AC104982.2-201ENST00000584258 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YY1P25490 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YY1P25490 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YY1P25490 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms