Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC175P0C221 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC175P0C221 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC175P0C221 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC175P0C221 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC175P0C221 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC175P0C221 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms