Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9Y3F1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms