Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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