Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms