Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms