Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms