Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MYRIPQ8NFW9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms