Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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