Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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