Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms