Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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