Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP8P40818 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP8P40818 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms