Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms