Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms