Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms