Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SPRR1BP22528 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms