Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms