Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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